Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHOX2AO14813 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHOX2AO14813 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHOX2AO14813 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHOX2AO14813 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms