Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARNTLO00327 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARNTLO00327 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARNTLO00327 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARNTLO00327 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARNTLO00327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARNTLO00327 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms