Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGRPO00253 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGRPO00253 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGRPO00253 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGRPO00253 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGRPO00253 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGRPO00253 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGRPO00253 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGRPO00253 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGRPO00253 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGRPO00253 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGRPO00253 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGRPO00253 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGRPO00253 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGRPO00253 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGRPO00253 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGRPO00253 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGRPO00253 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGRPO00253 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGRPO00253 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGRPO00253 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGRPO00253 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGRPO00253 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGRPO00253 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGRPO00253 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AGRPO00253 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGRPO00253 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGRPO00253 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AGRPO00253 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGRPO00253 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGRPO00253 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGRPO00253 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGRPO00253 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGRPO00253 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGRPO00253 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGRPO00253 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGRPO00253 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGRPO00253 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGRPO00253 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGRPO00253 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGRPO00253 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGRPO00253 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGRPO00253 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGRPO00253 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGRPO00253 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGRPO00253 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGRPO00253 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGRPO00253 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGRPO00253 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGRPO00253 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGRPO00253 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGRPO00253 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGRPO00253 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGRPO00253 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGRPO00253 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGRPO00253 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGRPO00253 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGRPO00253 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGRPO00253 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGRPO00253 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGRPO00253 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGRPO00253 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGRPO00253 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGRPO00253 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGRPO00253 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGRPO00253 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGRPO00253 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGRPO00253 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGRPO00253 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGRPO00253 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGRPO00253 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGRPO00253 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGRPO00253 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AGRPO00253 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGRPO00253 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGRPO00253 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGRPO00253 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGRPO00253 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGRPO00253 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AGRPO00253 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGRPO00253 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms