Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAPO00193 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAPO00193 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAPO00193 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAPO00193 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAPO00193 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAPO00193 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAPO00193 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAPO00193 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAPO00193 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAPO00193 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAPO00193 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAPO00193 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAPO00193 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAPO00193 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAPO00193 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAPO00193 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAPO00193 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAPO00193 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAPO00193 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAPO00193 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAPO00193 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAPO00193 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAPO00193 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAPO00193 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAPO00193 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAPO00193 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAPO00193 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAPO00193 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAPO00193 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAPO00193 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMAPO00193 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAPO00193 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAPO00193 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAPO00193 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAPO00193 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAPO00193 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAPO00193 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAPO00193 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAPO00193 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAPO00193 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMAPO00193 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAPO00193 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAPO00193 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAPO00193 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAPO00193 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAPO00193 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMAPO00193 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAPO00193 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAPO00193 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAPO00193 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAPO00193 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAPO00193 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAPO00193 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAPO00193 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAPO00193 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAPO00193 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAPO00193 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAPO00193 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAPO00193 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAPO00193 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAPO00193 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAPO00193 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAPO00193 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAPO00193 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAPO00193 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAPO00193 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAPO00193 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAPO00193 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAPO00193 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAPO00193 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAPO00193 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAPO00193 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAPO00193 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAPO00193 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAPO00193 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAPO00193 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAPO00193 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAPO00193 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAPO00193 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAPO00193 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAPO00193 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAPO00193 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAPO00193 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAPO00193 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAPO00193 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAPO00193 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAPO00193 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAPO00193 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAPO00193 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAPO00193 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAPO00193 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAPO00193 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAPO00193 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAPO00193 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms