Protein–RNA interactions for Protein: K9M1U5

IFNL4, Interferon lambda-4, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL4K9M1U5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNL4K9M1U5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFNL4K9M1U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL4K9M1U5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNL4K9M1U5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNL4K9M1U5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms