Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms