Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms