Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISM1B1AKI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISM1B1AKI9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ISM1B1AKI9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ISM1B1AKI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ISM1B1AKI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ISM1B1AKI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms