Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GOLGA8AA7E2F4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA8AA7E2F4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GOLGA8AA7E2F4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GOLGA8AA7E2F4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GOLGA8AA7E2F4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GOLGA8AA7E2F4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GOLGA8AA7E2F4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms