Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ARID3CA6NKF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARID3CA6NKF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ARID3CA6NKF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ARID3CA6NKF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARID3CA6NKF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARID3CA6NKF2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ARID3CA6NKF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
ARID3CA6NKF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARID3CA6NKF2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms