Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A7PA6NKC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM90A7PA6NKC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A7PA6NKC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM90A7PA6NKC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM90A7PA6NKC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms