Protein–RNA interactions for Protein: A6NJY4

Putative transmembrane protein LOC100289255, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NJY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A6NJY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A6NJY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NJY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NJY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A6NJY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NJY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A6NJY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A6NJY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
A6NJY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A6NJY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A6NJY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
A6NJY4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A6NJY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A6NJY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A6NJY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A6NJY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A6NJY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A6NJY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A6NJY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A6NJY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A6NJY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A6NJY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A6NJY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A6NJY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A6NJY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A6NJY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A6NJY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A6NJY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A6NJY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A6NJY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A6NJY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NJY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NJY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NJY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NJY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A6NJY4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A6NJY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A6NJY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NJY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NJY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NJY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A6NJY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NJY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NJY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NJY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A6NJY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NJY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NJY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NJY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A6NJY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NJY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NJY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A6NJY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NJY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NJY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A6NJY4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NJY4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NJY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
A6NJY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NJY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NJY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NJY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NJY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NJY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms