Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GOLGA6L3A6NEY3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GOLGA6L3A6NEY3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GOLGA6L3A6NEY3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6L3A6NEY3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GOLGA6L3A6NEY3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms