Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM221AA4D161 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM221AA4D161 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM221AA4D161 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM221AA4D161 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM221AA4D161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms