Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO3A2RU48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO3A2RU48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO3A2RU48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMCO3A2RU48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO3A2RU48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms