Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0B4J293 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J293 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J293 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J293 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J293 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J293 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms