Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
A0A087WWV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
A0A087WWV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
A0A087WWV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
A0A087WWV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A087WWV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms