Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOP58Q9Y2X3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms