RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.65■■■■■ 5.86
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.93■■■■■ 4.94
CCNE1-201ENST00000262643 ABCC9O60706 1549 aa45.2■■■■■ 4.83
CCNE1-201ENST00000262643 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.38■■■■■ 4.54
CCNE1-201ENST00000262643 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.33■■■■■ 4.53
CCNE1-201ENST00000262643 NACADO15069 1562 aa43.23■■■■■ 4.51
CCNE1-201ENST00000262643 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
CCNE1-201ENST00000262643 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.87■■■■■ 4.45
CCNE1-201ENST00000262643 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.65■■■■■ 4.42
CCNE1-201ENST00000262643 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.39■■■■■ 4.38
CCNE1-201ENST00000262643 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
CCNE1-201ENST00000262643 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.04■■■■■ 4.32
CCNE1-201ENST00000262643 SCRIBQ14160 1630 aa42.01■■■■■ 4.32
CCNE1-201ENST00000262643 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.64■■■■■ 4.26
CCNE1-201ENST00000262643 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.49■■■■■ 4.23
CCNE1-201ENST00000262643 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CCNE1-201ENST00000262643 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.84■■■■■ 4.13
CCNE1-201ENST00000262643 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.6■■■■■ 4.09
CCNE1-201ENST00000262643 SMARCA4P51532 1647 aa40.11■■■■■ 4.01
CCNE1-201ENST00000262643 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
CCNE1-201ENST00000262643 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.93■■■■□ 3.98
CCNE1-201ENST00000262643 NCAPD3P42695 1498 aa39.9■■■■□ 3.98
CCNE1-201ENST00000262643 SMARCA2P51531 1590 aa39.86■■■■□ 3.97
CCNE1-201ENST00000262643 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.84■■■■□ 3.97
CCNE1-201ENST00000262643 HMGXB3Q12766 1538 aa39.68■■■■□ 3.94
CCNE1-201ENST00000262643 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.67■■■■□ 3.94
CCNE1-201ENST00000262643 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CCNE1-201ENST00000262643 WIZO95785 1651 aa39.42■■■■□ 3.9
CCNE1-201ENST00000262643 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
CCNE1-201ENST00000262643 NESP48681 1621 aa39.08■■■■□ 3.85
CCNE1-201ENST00000262643 ERCC6Q03468 1493 aa38.97■■■■□ 3.83
CCNE1-201ENST00000262643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
CCNE1-201ENST00000262643 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.87■■■■□ 3.81
CCNE1-201ENST00000262643 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.76■■■■□ 3.8
CCNE1-201ENST00000262643 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.65■■■■□ 3.78
CCNE1-201ENST00000262643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.58■■■■□ 3.77
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.52■■■■□ 3.76
CCNE1-201ENST00000262643 CUX2O14529 1486 aa38.52■■■■□ 3.76
CCNE1-201ENST00000262643 CFTRP13569 1480 aa38.49■■■■□ 3.75
CCNE1-201ENST00000262643 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
CCNE1-201ENST00000262643 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
CCNE1-201ENST00000262643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.34■■■■□ 3.73
CCNE1-201ENST00000262643 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.3■■■■□ 3.72
CCNE1-201ENST00000262643 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.26■■■■□ 3.71
CCNE1-201ENST00000262643 PRDM2Q13029 1718 aa38.18■■■■□ 3.7
CCNE1-201ENST00000262643 WDR62O43379 1518 aa38.12■■■■□ 3.69
CCNE1-201ENST00000262643 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
CCNE1-201ENST00000262643 TOPBP1Q92547 1522 aa37.7■■■■□ 3.63
CCNE1-201ENST00000262643 ABCC8Q09428 1581 aa37.64■■■■□ 3.62
CCNE1-201ENST00000262643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.63■■■■□ 3.61
CCNE1-201ENST00000262643 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.61■■■■□ 3.61
CCNE1-201ENST00000262643 IFT140Q96RY7 1462 aa37.48■■■■□ 3.59
CCNE1-201ENST00000262643 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CCNE1-201ENST00000262643 CUX1P39880 1505 aa37.38■■■■□ 3.57
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CCNE1-201ENST00000262643 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
CCNE1-201ENST00000262643 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.28■■■■□ 3.56
CCNE1-201ENST00000262643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.25■■■■□ 3.55
CCNE1-201ENST00000262643 SOGA1O94964 1423 aa37.24■■■■□ 3.55
CCNE1-201ENST00000262643 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CCNE1-201ENST00000262643 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.54
CCNE1-201ENST00000262643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.53
CCNE1-201ENST00000262643 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CCNE1-201ENST00000262643 SYNJ1O43426 1573 aa37.01■■■■□ 3.52
CCNE1-201ENST00000262643 TOP2BQ02880 1626 aa37■■■■□ 3.51
CCNE1-201ENST00000262643 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.98■■■■□ 3.51
CCNE1-201ENST00000262643 OSCARQ8IYS5 282 aa36.97■■■■□ 3.51
CCNE1-201ENST00000262643 WDR97A6NE52 1622 aa36.93■■■■□ 3.5
CCNE1-201ENST00000262643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.88■■■■□ 3.49
CCNE1-201ENST00000262643 FBLN2P98095 1184 aa36.81■■■■□ 3.48
CCNE1-201ENST00000262643 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.8■■■■□ 3.48
CCNE1-201ENST00000262643 GRIN2BQ13224 1484 aa36.79■■■■□ 3.48
CCNE1-201ENST00000262643 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.79■■■■□ 3.48
CCNE1-201ENST00000262643 CHD1O14646 1710 aa36.77■■■■□ 3.48
CCNE1-201ENST00000262643 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.75■■■■□ 3.47
CCNE1-201ENST00000262643 PBRM1Q86U86 1689 aa36.72■■■■□ 3.47
CCNE1-201ENST00000262643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CCNE1-201ENST00000262643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CCNE1-201ENST00000262643 SYNJ2O15056 1496 aa36.57■■■■□ 3.44
CCNE1-201ENST00000262643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.42■■■■□ 3.42
CCNE1-201ENST00000262643 ADAMTS12P58397 1594 aa36.41■■■■□ 3.42
CCNE1-201ENST00000262643 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.38■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.38■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.38■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 TRIM41Q8WV44 630 aa36.37■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 ARHGEF11O15085 1522 aa36.35■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.34■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 GRIN2AQ12879 1464 aa36.32■■■■□ 3.41
CCNE1-201ENST00000262643 KIF27Q86VH2 1401 aa36.32■■■■□ 3.4
CCNE1-201ENST00000262643 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.32■■■■□ 3.4
CCNE1-201ENST00000262643 IGF1RP08069 1367 aa36.19■■■■□ 3.38
CCNE1-201ENST00000262643 CEP170Q5SW79 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
CCNE1-201ENST00000262643 NUP160Q12769 1436 aa36.14■■■■□ 3.38
CCNE1-201ENST00000262643 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.1■■■■□ 3.37
CCNE1-201ENST00000262643 CUL7Q14999 1698 aa36.07■■■■□ 3.36
CCNE1-201ENST00000262643 ARAP1Q96P48 1450 aa36.06■■■■□ 3.36
CCNE1-201ENST00000262643 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36■■■■□ 3.35
CCNE1-201ENST00000262643 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.98■■■■□ 3.35
CCNE1-201ENST00000262643 SHROOM2Q13796 1616 aa35.88■■■■□ 3.33
CCNE1-201ENST00000262643 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms