RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637156.1

CLN8-213, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-213ENST00000637156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.47■■■■■ 5.35
CLN8-213ENST00000637156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.26■■■■■ 4.36
CLN8-213ENST00000637156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CLN8-213ENST00000637156 ABCC9O60706 1549 aa40.43■■■■■ 4.06
CLN8-213ENST00000637156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.29■■■■■ 4.04
CLN8-213ENST00000637156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.03■■■■■ 4
CLN8-213ENST00000637156 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
CLN8-213ENST00000637156 NACADO15069 1562 aa39.54■■■■□ 3.92
CLN8-213ENST00000637156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.36■■■■□ 3.89
CLN8-213ENST00000637156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
CLN8-213ENST00000637156 SCRIBQ14160 1630 aa38.89■■■■□ 3.82
CLN8-213ENST00000637156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.38■■■■□ 3.74
CLN8-213ENST00000637156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.18■■■■□ 3.7
CLN8-213ENST00000637156 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.13■■■■□ 3.69
CLN8-213ENST00000637156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
CLN8-213ENST00000637156 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.75■■■■□ 3.63
CLN8-213ENST00000637156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
CLN8-213ENST00000637156 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.45■■■■□ 3.59
CLN8-213ENST00000637156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CLN8-213ENST00000637156 SMARCA4P51532 1647 aa37.26■■■■□ 3.55
CLN8-213ENST00000637156 WIZO95785 1651 aa37.07■■■■□ 3.53
CLN8-213ENST00000637156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
CLN8-213ENST00000637156 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.84■■■■□ 3.49
CLN8-213ENST00000637156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.83■■■■□ 3.49
CLN8-213ENST00000637156 SMARCA2P51531 1590 aa36.71■■■■□ 3.47
CLN8-213ENST00000637156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CLN8-213ENST00000637156 NCAPD3P42695 1498 aa36.58■■■■□ 3.45
CLN8-213ENST00000637156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
CLN8-213ENST00000637156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.53■■■■□ 3.44
CLN8-213ENST00000637156 HMGXB3Q12766 1538 aa36.39■■■■□ 3.42
CLN8-213ENST00000637156 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.37■■■■□ 3.41
CLN8-213ENST00000637156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.14■■■■□ 3.38
CLN8-213ENST00000637156 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.98■■■■□ 3.35
CLN8-213ENST00000637156 CFTRP13569 1480 aa35.66■■■■□ 3.3
CLN8-213ENST00000637156 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.64■■■■□ 3.3
CLN8-213ENST00000637156 TRIM41Q8WV44 630 aa35.52■■■■□ 3.28
CLN8-213ENST00000637156 ABCC8Q09428 1581 aa35.45■■■■□ 3.26
CLN8-213ENST00000637156 NESP48681 1621 aa35.41■■■■□ 3.26
CLN8-213ENST00000637156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.29■■■■□ 3.24
CLN8-213ENST00000637156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
CLN8-213ENST00000637156 PRDM2Q13029 1718 aa35.21■■■■□ 3.23
CLN8-213ENST00000637156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.19■■■■□ 3.22
CLN8-213ENST00000637156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.11■■■■□ 3.21
CLN8-213ENST00000637156 SYNJ1O43426 1573 aa35.1■■■■□ 3.21
CLN8-213ENST00000637156 CUX1P39880 1505 aa35.01■■■■□ 3.2
CLN8-213ENST00000637156 TOP2BQ02880 1626 aa34.97■■■■□ 3.19
CLN8-213ENST00000637156 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.96■■■■□ 3.19
CLN8-213ENST00000637156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.9■■■■□ 3.18
CLN8-213ENST00000637156 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
CLN8-213ENST00000637156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.84■■■■□ 3.17
CLN8-213ENST00000637156 SOGA1O94964 1423 aa34.8■■■■□ 3.16
CLN8-213ENST00000637156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CLN8-213ENST00000637156 TOPBP1Q92547 1522 aa34.76■■■■□ 3.15
CLN8-213ENST00000637156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.74■■■■□ 3.15
CLN8-213ENST00000637156 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.69■■■■□ 3.14
CLN8-213ENST00000637156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.67■■■■□ 3.14
CLN8-213ENST00000637156 ERCC6Q03468 1493 aa34.66■■■■□ 3.14
CLN8-213ENST00000637156 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.65■■■■□ 3.14
CLN8-213ENST00000637156 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.62■■■■□ 3.13
CLN8-213ENST00000637156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CLN8-213ENST00000637156 EEA1Q15075 1411 aa34.55■■■■□ 3.12
CLN8-213ENST00000637156 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.54■■■■□ 3.12
CLN8-213ENST00000637156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.5■■■■□ 3.11
CLN8-213ENST00000637156 WDR62O43379 1518 aa34.44■■■■□ 3.1
CLN8-213ENST00000637156 KIF27Q86VH2 1401 aa34.42■■■■□ 3.1
CLN8-213ENST00000637156 CUX2O14529 1486 aa34.41■■■■□ 3.1
CLN8-213ENST00000637156 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.39■■■■□ 3.1
CLN8-213ENST00000637156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CLN8-213ENST00000637156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
CLN8-213ENST00000637156 IGF1RP08069 1367 aa34.25■■■■□ 3.07
CLN8-213ENST00000637156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CLN8-213ENST00000637156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CLN8-213ENST00000637156 IFT140Q96RY7 1462 aa34.17■■■■□ 3.06
CLN8-213ENST00000637156 WDR97A6NE52 1622 aa34.16■■■■□ 3.06
CLN8-213ENST00000637156 PRXQ9BXM0 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
CLN8-213ENST00000637156 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.08■■■■□ 3.05
CLN8-213ENST00000637156 KIF21BO75037 1637 aa34.07■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 GOLGA3Q08378 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.06■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.05■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.03■■■■□ 3.04
CLN8-213ENST00000637156 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.97■■■■□ 3.03
CLN8-213ENST00000637156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.93■■■■□ 3.02
CLN8-213ENST00000637156 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
CLN8-213ENST00000637156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
CLN8-213ENST00000637156 CUL7Q14999 1698 aa33.79■■■■□ 3
CLN8-213ENST00000637156 PBRM1Q86U86 1689 aa33.76■■■□□ 2.99
CLN8-213ENST00000637156 CEP162Q5TB80 1403 aa33.72■■■□□ 2.99
CLN8-213ENST00000637156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.71■■■□□ 2.99
CLN8-213ENST00000637156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.66■■■□□ 2.98
CLN8-213ENST00000637156 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CLN8-213ENST00000637156 ADAMTS12P58397 1594 aa33.61■■■□□ 2.97
CLN8-213ENST00000637156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.97
CLN8-213ENST00000637156 CLIP1P30622 1438 aa33.55■■■□□ 2.96
CLN8-213ENST00000637156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
CLN8-213ENST00000637156 SYNJ2O15056 1496 aa33.48■■■□□ 2.95
CLN8-213ENST00000637156 FBLN2P98095 1184 aa33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.2 ms