Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms