RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279263.11

TM7SF2-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-201ENST00000279263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.66■■■■■ 5.38
TM7SF2-201ENST00000279263 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.7■■■■■ 4.43
TM7SF2-201ENST00000279263 ABCC9O60706 1549 aa40.83■■■■■ 4.13
TM7SF2-201ENST00000279263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TM7SF2-201ENST00000279263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
TM7SF2-201ENST00000279263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.21■■■■■ 4.03
TM7SF2-201ENST00000279263 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF2-201ENST00000279263 NACADO15069 1562 aa39.86■■■■□ 3.97
TM7SF2-201ENST00000279263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.66■■■■□ 3.94
TM7SF2-201ENST00000279263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.41■■■■□ 3.9
TM7SF2-201ENST00000279263 SCRIBQ14160 1630 aa39.24■■■■□ 3.87
TM7SF2-201ENST00000279263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.84■■■■□ 3.81
TM7SF2-201ENST00000279263 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.44■■■■□ 3.74
TM7SF2-201ENST00000279263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.73
TM7SF2-201ENST00000279263 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.86■■■■□ 3.65
TM7SF2-201ENST00000279263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TM7SF2-201ENST00000279263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
TM7SF2-201ENST00000279263 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.59■■■■□ 3.61
TM7SF2-201ENST00000279263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
TM7SF2-201ENST00000279263 SMARCA4P51532 1647 aa37.54■■■■□ 3.6
TM7SF2-201ENST00000279263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
TM7SF2-201ENST00000279263 WIZO95785 1651 aa37.28■■■■□ 3.56
TM7SF2-201ENST00000279263 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.07■■■■□ 3.52
TM7SF2-201ENST00000279263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.02■■■■□ 3.52
TM7SF2-201ENST00000279263 SMARCA2P51531 1590 aa37.01■■■■□ 3.51
TM7SF2-201ENST00000279263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.92■■■■□ 3.5
TM7SF2-201ENST00000279263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
TM7SF2-201ENST00000279263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
TM7SF2-201ENST00000279263 NCAPD3P42695 1498 aa36.76■■■■□ 3.47
TM7SF2-201ENST00000279263 HMGXB3Q12766 1538 aa36.71■■■■□ 3.47
TM7SF2-201ENST00000279263 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.46■■■■□ 3.43
TM7SF2-201ENST00000279263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.36■■■■□ 3.41
TM7SF2-201ENST00000279263 CFTRP13569 1480 aa35.82■■■■□ 3.33
TM7SF2-201ENST00000279263 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.8■■■■□ 3.32
TM7SF2-201ENST00000279263 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.72■■■■□ 3.31
TM7SF2-201ENST00000279263 NESP48681 1621 aa35.68■■■■□ 3.3
TM7SF2-201ENST00000279263 PRDM2Q13029 1718 aa35.67■■■■□ 3.3
TM7SF2-201ENST00000279263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.64■■■■□ 3.3
TM7SF2-201ENST00000279263 ABCC8Q09428 1581 aa35.58■■■■□ 3.29
TM7SF2-201ENST00000279263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.44■■■■□ 3.26
TM7SF2-201ENST00000279263 TRIM41Q8WV44 630 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF2-201ENST00000279263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.265e-6■■■■■ 29.2
TM7SF2-201ENST00000279263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.37■■■■□ 3.25
TM7SF2-201ENST00000279263 SYNJ1O43426 1573 aa35.28■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.28■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 CUX1P39880 1505 aa35.19■■■■□ 3.22
TM7SF2-201ENST00000279263 TOP2BQ02880 1626 aa35.16■■■■□ 3.22
TM7SF2-201ENST00000279263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.14■■■■□ 3.22
TM7SF2-201ENST00000279263 ERCC6Q03468 1493 aa35.09■■■■□ 3.21
TM7SF2-201ENST00000279263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
TM7SF2-201ENST00000279263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
TM7SF2-201ENST00000279263 TOPBP1Q92547 1522 aa35■■■■□ 3.19
TM7SF2-201ENST00000279263 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.96■■■■□ 3.19
TM7SF2-201ENST00000279263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.9■■■■□ 3.18
TM7SF2-201ENST00000279263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
TM7SF2-201ENST00000279263 WDR62O43379 1518 aa34.79■■■■□ 3.16
TM7SF2-201ENST00000279263 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
TM7SF2-201ENST00000279263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
TM7SF2-201ENST00000279263 SOGA1O94964 1423 aa34.78■■■■□ 3.16
TM7SF2-201ENST00000279263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.67■■■■□ 3.14
TM7SF2-201ENST00000279263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.67■■■■□ 3.14
TM7SF2-201ENST00000279263 EEA1Q15075 1411 aa34.61■■■■□ 3.13
TM7SF2-201ENST00000279263 CUX2O14529 1486 aa34.58■■■■□ 3.13
TM7SF2-201ENST00000279263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.55■■■■□ 3.12
TM7SF2-201ENST00000279263 KIF27Q86VH2 1401 aa34.54■■■■□ 3.12
TM7SF2-201ENST00000279263 WDR97A6NE52 1622 aa34.52■■■■□ 3.12
TM7SF2-201ENST00000279263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
TM7SF2-201ENST00000279263 IFT140Q96RY7 1462 aa34.44■■■■□ 3.1
TM7SF2-201ENST00000279263 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.44■■■■□ 3.1
TM7SF2-201ENST00000279263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
TM7SF2-201ENST00000279263 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.35■■■■□ 3.09
TM7SF2-201ENST00000279263 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.35■■■■□ 3.09
TM7SF2-201ENST00000279263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.34■■■■□ 3.09
TM7SF2-201ENST00000279263 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.28■■■■□ 3.08
TM7SF2-201ENST00000279263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
TM7SF2-201ENST00000279263 IGF1RP08069 1367 aa34.23■■■■□ 3.07
TM7SF2-201ENST00000279263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.078e-6■■■■□ 23.2
TM7SF2-201ENST00000279263 KIF21BO75037 1637 aa34.21■■■■□ 3.07
TM7SF2-201ENST00000279263 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
TM7SF2-201ENST00000279263 PBRM1Q86U86 1689 aa34.17■■■■□ 3.06
TM7SF2-201ENST00000279263 PRXQ9BXM0 1461 aa34.16■■■■□ 3.06
TM7SF2-201ENST00000279263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.15■■■■□ 3.06
TM7SF2-201ENST00000279263 GOLGA3Q08378 1498 aa34.14■■■■□ 3.06
TM7SF2-201ENST00000279263 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.11■■■■□ 3.05
TM7SF2-201ENST00000279263 CUL7Q14999 1698 aa34.09■■■■□ 3.05
TM7SF2-201ENST00000279263 GRIN2BQ13224 1484 aa34.09■■■■□ 3.05
TM7SF2-201ENST00000279263 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.08■■■■□ 3.05
TM7SF2-201ENST00000279263 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
TM7SF2-201ENST00000279263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.95■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 ADAMTS12P58397 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.89■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.89■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
TM7SF2-201ENST00000279263 SYNJ2O15056 1496 aa33.73■■■□□ 2.99
TM7SF2-201ENST00000279263 CEP162Q5TB80 1403 aa33.72■■■□□ 2.99
TM7SF2-201ENST00000279263 GRIN2AQ12879 1464 aa33.68■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 FBLN2P98095 1184 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.7 ms