RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279263.11

TM7SF2-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-201ENST00000279263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.66■■■■■ 5.38
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TM7SF2-201ENST00000279263 SMARCA2P51531 1590 aa37.01■■■■□ 3.51
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TM7SF2-201ENST00000279263 NESP48681 1621 aa35.68■■■■□ 3.3
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TM7SF2-201ENST00000279263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.64■■■■□ 3.3
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TM7SF2-201ENST00000279263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.44■■■■□ 3.26
TM7SF2-201ENST00000279263 TRIM41Q8WV44 630 aa35.43■■■■□ 3.26
TM7SF2-201ENST00000279263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.265e-6■■■■■ 29.2
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TM7SF2-201ENST00000279263 SYNJ1O43426 1573 aa35.28■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.28■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.27■■■■□ 3.24
TM7SF2-201ENST00000279263 CUX1P39880 1505 aa35.19■■■■□ 3.22
TM7SF2-201ENST00000279263 TOP2BQ02880 1626 aa35.16■■■■□ 3.22
TM7SF2-201ENST00000279263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.14■■■■□ 3.22
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TM7SF2-201ENST00000279263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.9■■■■□ 3.18
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TM7SF2-201ENST00000279263 CUX2O14529 1486 aa34.58■■■■□ 3.13
TM7SF2-201ENST00000279263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.55■■■■□ 3.12
TM7SF2-201ENST00000279263 KIF27Q86VH2 1401 aa34.54■■■■□ 3.12
TM7SF2-201ENST00000279263 WDR97A6NE52 1622 aa34.52■■■■□ 3.12
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TM7SF2-201ENST00000279263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.34■■■■□ 3.09
TM7SF2-201ENST00000279263 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.28■■■■□ 3.08
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TM7SF2-201ENST00000279263 GRIN2BQ13224 1484 aa34.09■■■■□ 3.05
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TM7SF2-201ENST00000279263 ADAMTS12P58397 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.89■■■■□ 3.02
TM7SF2-201ENST00000279263 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.89■■■■□ 3.02
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TM7SF2-201ENST00000279263 SYNJ2O15056 1496 aa33.73■■■□□ 2.99
TM7SF2-201ENST00000279263 CEP162Q5TB80 1403 aa33.72■■■□□ 2.99
TM7SF2-201ENST00000279263 GRIN2AQ12879 1464 aa33.68■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 FBLN2P98095 1184 aa33.67■■■□□ 2.98
TM7SF2-201ENST00000279263 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.66■■■□□ 2.98
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