RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.79■■■■■ 4.6
VGF-201ENST00000249330 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.83■■■■□ 3.65
VGF-201ENST00000249330 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
VGF-201ENST00000249330 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.54■■■■□ 3.44
VGF-201ENST00000249330 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.3■■■■□ 3.4
VGF-201ENST00000249330 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36■■■■□ 3.35
VGF-201ENST00000249330 ABCC9O60706 1549 aa36■■■■□ 3.35
VGF-201ENST00000249330 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.44■■■■□ 3.26
VGF-201ENST00000249330 NACADO15069 1562 aa35.27■■■■□ 3.24
VGF-201ENST00000249330 SCRIBQ14160 1630 aa35.16■■■■□ 3.22
VGF-201ENST00000249330 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
VGF-201ENST00000249330 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.95■■■■□ 3.19
VGF-201ENST00000249330 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.33■■■■□ 3.09
VGF-201ENST00000249330 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.19■■■■□ 3.06
VGF-201ENST00000249330 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
VGF-201ENST00000249330 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.15■■■■□ 3.06
VGF-201ENST00000249330 BICRAQ9NZM4 1560 aa34■■■■□ 3.03
VGF-201ENST00000249330 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.95■■■■□ 3.02
VGF-201ENST00000249330 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
VGF-201ENST00000249330 WIZO95785 1651 aa33.68■■■□□ 2.98
VGF-201ENST00000249330 SMARCA4P51532 1647 aa33.58■■■□□ 2.97
VGF-201ENST00000249330 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.53■■■□□ 2.96
VGF-201ENST00000249330 HRCP23327 699 aa33.26■■■□□ 2.91
VGF-201ENST00000249330 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
VGF-201ENST00000249330 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.05■■■□□ 2.88
VGF-201ENST00000249330 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.03■■■□□ 2.88
VGF-201ENST00000249330 CCDC88BA6NC98 1476 aa33■■■□□ 2.87
VGF-201ENST00000249330 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
VGF-201ENST00000249330 SMARCA2P51531 1590 aa32.94■■■□□ 2.86
VGF-201ENST00000249330 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
VGF-201ENST00000249330 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.83■■■□□ 2.85
VGF-201ENST00000249330 TRIM41Q8WV44 630 aa32.78■■■□□ 2.84
VGF-201ENST00000249330 NCAPD3P42695 1498 aa32.64■■■□□ 2.82
VGF-201ENST00000249330 HMGXB3Q12766 1538 aa32.52■■■□□ 2.8
VGF-201ENST00000249330 ABCC8Q09428 1581 aa32.46■■■□□ 2.79
VGF-201ENST00000249330 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.44■■■□□ 2.78
VGF-201ENST00000249330 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.44■■■□□ 2.78
VGF-201ENST00000249330 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
VGF-201ENST00000249330 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
VGF-201ENST00000249330 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
VGF-201ENST00000249330 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
VGF-201ENST00000249330 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.1■■■□□ 2.73
VGF-201ENST00000249330 CFTRP13569 1480 aa32.02■■■□□ 2.72
VGF-201ENST00000249330 SYNJ1O43426 1573 aa31.99■■■□□ 2.71
VGF-201ENST00000249330 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.94■■■□□ 2.7
VGF-201ENST00000249330 SOGA1O94964 1423 aa31.94■■■□□ 2.7
VGF-201ENST00000249330 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.91■■■□□ 2.7
VGF-201ENST00000249330 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.84■■■□□ 2.69
VGF-201ENST00000249330 TOP2BQ02880 1626 aa31.73■■■□□ 2.67
VGF-201ENST00000249330 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
VGF-201ENST00000249330 NESP48681 1621 aa31.7■■■□□ 2.66
VGF-201ENST00000249330 CUX1P39880 1505 aa31.69■■■□□ 2.66
VGF-201ENST00000249330 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.67■■■□□ 2.66
VGF-201ENST00000249330 PRDM2Q13029 1718 aa31.66■■■□□ 2.66
VGF-201ENST00000249330 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.64■■■□□ 2.65
VGF-201ENST00000249330 EEA1Q15075 1411 aa31.61■■■□□ 2.65
VGF-201ENST00000249330 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.56■■■□□ 2.64
VGF-201ENST00000249330 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.43■■■□□ 2.62
VGF-201ENST00000249330 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
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VGF-201ENST00000249330 GOLGA3Q08378 1498 aa31.3■■■□□ 2.6
VGF-201ENST00000249330 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.29■■■□□ 2.6
VGF-201ENST00000249330 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.27■■■□□ 2.6
VGF-201ENST00000249330 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.26■■■□□ 2.6
VGF-201ENST00000249330 KIF27Q86VH2 1401 aa31.25■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 TOPBP1Q92547 1522 aa31.23■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 KIF21BO75037 1637 aa31.22■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.21■■■□□ 2.59
VGF-201ENST00000249330 CEP162Q5TB80 1403 aa31.19■■■□□ 2.58
VGF-201ENST00000249330 CUX2O14529 1486 aa31.18■■■□□ 2.58
VGF-201ENST00000249330 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
VGF-201ENST00000249330 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
VGF-201ENST00000249330 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.13■■■□□ 2.57
VGF-201ENST00000249330 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
VGF-201ENST00000249330 PRXQ9BXM0 1461 aa31.09■■■□□ 2.57
VGF-201ENST00000249330 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
VGF-201ENST00000249330 IGF1RP08069 1367 aa31.04■■■□□ 2.56
VGF-201ENST00000249330 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
VGF-201ENST00000249330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.95■■■□□ 2.54
VGF-201ENST00000249330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.95■■■□□ 2.54
VGF-201ENST00000249330 CLIP1P30622 1438 aa30.89■■■□□ 2.54
VGF-201ENST00000249330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.87■■■□□ 2.53
VGF-201ENST00000249330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
VGF-201ENST00000249330 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.83■■■□□ 2.53
VGF-201ENST00000249330 ERCC6Q03468 1493 aa30.75■■■□□ 2.51
VGF-201ENST00000249330 WDR97A6NE52 1622 aa30.75■■■□□ 2.51
VGF-201ENST00000249330 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
VGF-201ENST00000249330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
VGF-201ENST00000249330 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
VGF-201ENST00000249330 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
VGF-201ENST00000249330 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.68■■■□□ 2.5
VGF-201ENST00000249330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.65■■■□□ 2.5
VGF-201ENST00000249330 WDR62O43379 1518 aa30.63■■■□□ 2.49
VGF-201ENST00000249330 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.6■■■□□ 2.49
VGF-201ENST00000249330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
VGF-201ENST00000249330 CUL7Q14999 1698 aa30.54■■■□□ 2.48
VGF-201ENST00000249330 ARAP1Q96P48 1450 aa30.54■■■□□ 2.48
VGF-201ENST00000249330 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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