Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTHFD1P11586 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms