RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.82■■■■■ 4.28
RPS6KL1-216ENST00000557413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.94■■■■□ 3.34
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RPS6KL1-216ENST00000557413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.4■■■■□ 3.26
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.62■■■■□ 3.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.6■■■■□ 3.13
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.57■■■■□ 3.12
RPS6KL1-216ENST00000557413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.3■■■■□ 3.08
RPS6KL1-216ENST00000557413 HRCP23327 699 aa34.22■■■■□ 3.07
RPS6KL1-216ENST00000557413 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.95■■■■□ 3.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.61■■■□□ 2.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC9O60706 1549 aa33.54■■■□□ 2.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCRIBQ14160 1630 aa33.25■■■□□ 2.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
RPS6KL1-216ENST00000557413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.98■■■□□ 2.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM41Q8WV44 630 aa32.97■■■□□ 2.87
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
RPS6KL1-216ENST00000557413 NACADO15069 1562 aa32.62■■■□□ 2.81
RPS6KL1-216ENST00000557413 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.59■■■□□ 2.81
RPS6KL1-216ENST00000557413 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.53■■■□□ 2.8
RPS6KL1-216ENST00000557413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.42■■■□□ 2.78
RPS6KL1-216ENST00000557413 WIZO95785 1651 aa32.41■■■□□ 2.78
RPS6KL1-216ENST00000557413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
RPS6KL1-216ENST00000557413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC8Q09428 1581 aa31.82■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMARCA4P51532 1647 aa31.79■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.76■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMARCA2P51531 1590 aa31.73■■■□□ 2.67
RPS6KL1-216ENST00000557413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.66
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP162Q5TB80 1403 aa31.63■■■□□ 2.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 SOGA1O94964 1423 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
RPS6KL1-216ENST00000557413 EEA1Q15075 1411 aa31.49■■■□□ 2.63
RPS6KL1-216ENST00000557413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.43■■■□□ 2.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.39■■■□□ 2.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 GOLGA3Q08378 1498 aa31.3■■■□□ 2.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEUROD1Q13562 356 aa31.26■■■□□ 2.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.14■■■□□ 2.58
RPS6KL1-216ENST00000557413 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
RPS6KL1-216ENST00000557413 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.13■■■□□ 2.57
RPS6KL1-216ENST00000557413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.57
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.08■■■□□ 2.57
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYNJ1O43426 1573 aa31.07■■■□□ 2.56
RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF21BO75037 1637 aa31.06■■■□□ 2.56
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
RPS6KL1-216ENST00000557413 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31■■■□□ 2.55
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLIP1P30622 1438 aa30.95■■■□□ 2.55
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RPS6KL1-216ENST00000557413 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.87■■■□□ 2.53
RPS6KL1-216ENST00000557413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.85■■■□□ 2.53
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.8■■■□□ 2.52
RPS6KL1-216ENST00000557413 APLP2Q06481 763 aa30.76■■■□□ 2.51
RPS6KL1-216ENST00000557413 TOP2BQ02880 1626 aa30.66■■■□□ 2.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
RPS6KL1-216ENST00000557413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 MIER1Q8N108 512 aa30.62■■■□□ 2.49
RPS6KL1-216ENST00000557413 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.54■■■□□ 2.48
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.49■■■□□ 2.47
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRXQ9BXM0 1461 aa30.44■■■□□ 2.46
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARAP1Q96P48 1450 aa30.4■■■□□ 2.46
RPS6KL1-216ENST00000557413 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.4■■■□□ 2.46
RPS6KL1-216ENST00000557413 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
RPS6KL1-216ENST00000557413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
RPS6KL1-216ENST00000557413 CUX1P39880 1505 aa30.26■■■□□ 2.43
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RPS6KL1-216ENST00000557413 KIF27Q86VH2 1401 aa30.22■■■□□ 2.43
RPS6KL1-216ENST00000557413 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
RPS6KL1-216ENST00000557413 NCAPD3P42695 1498 aa30.18■■■□□ 2.42
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RPS6KL1-216ENST00000557413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.84■■■□□ 2.37
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAP3K1Q13233 1512 aa29.82■■■□□ 2.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAPKBP1O60336 1514 aa29.79■■■□□ 2.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
RPS6KL1-216ENST00000557413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.73■■■□□ 2.35
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.72■■■□□ 2.35
RPS6KL1-216ENST00000557413 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.71■■■□□ 2.35
RPS6KL1-216ENST00000557413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.67■■■□□ 2.34
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