Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF330Q9Y3S2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF330Q9Y3S2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF330Q9Y3S2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF330Q9Y3S2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF330Q9Y3S2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF330Q9Y3S2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF330Q9Y3S2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms