Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIGD1AQ9Y241 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIGD1AQ9Y241 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HIGD1AQ9Y241 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIGD1AQ9Y241 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms