Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SHANK2Q9UPX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SHANK2Q9UPX8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SHANK2Q9UPX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SHANK2Q9UPX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SHANK2Q9UPX8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHANK2Q9UPX8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SHANK2Q9UPX8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SHANK2Q9UPX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SHANK2Q9UPX8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SHANK2Q9UPX8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SHANK2Q9UPX8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHANK2Q9UPX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.05■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SHANK2Q9UPX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms