Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AP4E1Q9UPM8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP4E1Q9UPM8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP4E1Q9UPM8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP4E1Q9UPM8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP4E1Q9UPM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms