Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP18Q9UMW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP18Q9UMW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP18Q9UMW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP18Q9UMW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP18Q9UMW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP18Q9UMW8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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