Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI9

POU2F3, POU domain, class 2, transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU2F3Q9UKI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU2F3Q9UKI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU2F3Q9UKI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU2F3Q9UKI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POU2F3Q9UKI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POU2F3Q9UKI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU2F3Q9UKI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms