Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MED13Q9UHV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED13Q9UHV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED13Q9UHV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED13Q9UHV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED13Q9UHV7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms