Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGXB4Q9UGU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGXB4Q9UGU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGXB4Q9UGU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGXB4Q9UGU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGXB4Q9UGU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGXB4Q9UGU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HMGXB4Q9UGU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms