Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPARGC1AQ9UBK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPARGC1AQ9UBK2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPARGC1AQ9UBK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARGC1AQ9UBK2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARGC1AQ9UBK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms