Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNMT3BQ9UBC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNMT3BQ9UBC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNMT3BQ9UBC3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT3BQ9UBC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms