Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRD1Q9P1U0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNRD1Q9P1U0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNRD1Q9P1U0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNRD1Q9P1U0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRD1Q9P1U0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms