Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PRO2289Q9P1D8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PRO2289Q9P1D8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PRO2289Q9P1D8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms