Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD3Q9NZN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD3Q9NZN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EHD3Q9NZN3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EHD3Q9NZN3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EHD3Q9NZN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms