Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWC5

TMEM45A, Transmembrane protein 45A, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM45AQ9NWC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM45AQ9NWC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM45AQ9NWC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM45AQ9NWC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM45AQ9NWC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM45AQ9NWC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM45AQ9NWC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM45AQ9NWC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM45AQ9NWC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms