Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDREJQ9NTG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKDREJQ9NTG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKDREJQ9NTG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKDREJQ9NTG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms