Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GKN1Q9NS71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GKN1Q9NS71 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GKN1Q9NS71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GKN1Q9NS71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GKN1Q9NS71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GKN1Q9NS71 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms