Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOPORSQ9NS56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPORSQ9NS56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPORSQ9NS56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPORSQ9NS56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms