Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRMS1Q9HCU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRMS1Q9HCU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRMS1Q9HCU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
BRMS1Q9HCU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRMS1Q9HCU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms