Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNHG12Q9BXW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNHG12Q9BXW3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNHG12Q9BXW3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNHG12Q9BXW3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNHG12Q9BXW3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNHG12Q9BXW3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms