Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPK3BQ9BT76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPK3BQ9BT76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPK3BQ9BT76 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UPK3BQ9BT76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UPK3BQ9BT76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms