Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTKNQ9BST9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTKNQ9BST9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTKNQ9BST9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTKNQ9BST9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTKNQ9BST9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTKNQ9BST9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTKNQ9BST9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTKNQ9BST9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms