Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS4Q9BRT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS4Q9BRT9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS4Q9BRT9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GINS4Q9BRT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms