Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC17Q9BRA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TXNDC17Q9BRA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TXNDC17Q9BRA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TXNDC17Q9BRA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms