Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD5Q99717 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMAD5Q99717 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD5Q99717 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD5Q99717 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD5Q99717 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD5Q99717 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD5Q99717 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms