Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1Q99536 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VAT1Q99536 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAT1Q99536 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAT1Q99536 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAT1Q99536 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms